Nie wiem jak z FSUIPC, gdyż używałem tylko wersji darmowej i tylko jeśli jakiś addon tego wymagał, ale sprawdzałeś HID Macros?
http://www.hidmacros.eu/Można w nim wybrać dany sprzęt w zakładce Devices, a w Macros wybrać daną komendę, która przez SimConnect może iść bezpośrednio do FSXa. Używałem kiedyś z oddzielną klawiaturą, i działało poprawnie, tzn. przy włączonym programie pierwsza klawiatura służyła do pisania, druga wysyłała komendy. Mniemam więc, że z dwiema też powinno działać.
PS. W moim przypadku pierwsze uruchomienie programu trwa dość długo, komputer się freezuje, wyskakuje też alert firewalla (ale niegroźny, połączone z localhostem, czyli z "samym sobą"), przy kolejnych uruchomieniach nie ma problemu.